大綱面板不只是用來導覽——你可以直接在面板中重組文件，不必在編輯器裡上下捲動。重新命名、新增、刪除與重新排序章節，全都能在大綱樹中完成。
重新命名標題
若要重新命名標題，請在大綱中選取該標題並按下 F2，或按兩下該項目。樹狀結構中會出現內嵌文字欄位。輸入新的標題文字後按 Enter 確認，或按 Escape 取消。你也可以在項目上按右鍵並選擇 編輯。
變更會直接寫入文件中對應的行。標題標記（例如 ##）會保留，只有其後的文字會變更。
新增標題
在大綱中的任一項目按右鍵即可開啟快捷選單：
- 新增同層項目 會在所選項目之後插入一個相同層級的標題。
- 新增子項目 會插入比所選項目深一層的子標題。
新節點會開啟內嵌編輯模式，讓你立即輸入文字。（在根項目上無法使用 新增同層項目。）
刪除標題
在大綱中的標題上按右鍵並選擇 刪除。這會移除該標題及其所有內容——包括其下的段落、清單與巢狀子標題。系統會先顯示確認提示；你可以在 設定 > 一般 中關閉此提示。（根項目無法刪除。）
以拖放方式重新排序章節
將任一大綱項目拖曳到樹狀結構中的新位置即可重新排序章節。拖曳時會顯示插入指示線，標示放開後章節將落在何處。預設會在移動完成前顯示確認提示——此提示可在 設定 > 一般 中關閉。
當你放下章節時，MarkNode 會將該標題行及其所有內容——包括巢狀子標題及其內容——移動到文件中的新位置。文件文字會依照大綱的新順序重新組織。
有幾點需要留意：
- 將章節放到另一個章節上，會使其成為該父章節的最後一個子項目，也就是子章節。
- 放在同層級的兩個章節之間，則會成為該位置的同層項目。
- 復原（
Cmd/Ctrl+Z）會將拖放重新排序視為單一操作復原。
快捷選單參考
在任一大綱項目上按右鍵會顯示下列選項：
| 動作 | 說明 |
|---|---|
| 新增子項目 | 插入深一層的子標題 |
| 新增同層項目 | 在所選項目之後插入同層標題（根項目無法使用） |
| 編輯 | 進入內嵌重新命名模式（同 F2） |
| 刪除 | 移除該標題及其下方所有內容（根項目無法使用） |